國家人權記憶庫

本案遠因主要來自蔡孝乾於1945年9月接受中共周恩來的囑託，在臺灣籌建地下黨，歷經數個月的準備後，蔡在淮北成立臺灣省工作委員會，該委員會於1949年5月之前由上海局（後改為華東局）領導。1947年二二八事件爆發，臺灣省工作委員會藉此與思想左傾者或是對國民政府失望者結合，隨後成立中共臺灣省工委會臺北市工委會。
本案之所以被破獲，一是因來自於林秋興所帶的臺北市工委會工作報告書；一是因來自於張秀伯被捕獲。
以官方的資料來看，本案的案件構成可以從介紹人與支部組成區分幾個軸線，彼此之間也有些關係：
第一是郭琇琮擔任臺北市工委會書記以及以臺灣大學醫學院助教身份，直接領導臺灣大學附屬醫院支部。吸收吳思漢、許強、胡寶珍、林雪嬌等人加入。陳勤則是由林雪嬌的關係而涉入。吳思漢於1947年7月加入共產黨後，吸收王耀勳、陳金木、邱來傳、吳金城、張添丁參加。進而發展出數個支部，相關人等也成為本案的被告。
第二條軸線是草山支部。屬於這個支部者有鄧火生、劉永福、蘇炳、蔡惠雍、李東益等。
第三條軸線是士林熱帶醫學研究所支部。有林慶雲、謝湧鏡、許燈炎等。此支部影響著草山支部的成立與運作。
第四條軸線是為李水井的關係網絡。包含盧志彬、何明泉、高明柏、劉碧堂（陳炯澤的部分則是因為劉碧堂的關係而涉入）、蘇芳宗、陳茂東。鄭溪北雖然是因為尤寬仁而入黨，後來也是由李水井所領導。另外也可以算入張國雄這一條次支線。由於藍明谷的關係，張國雄參加共產黨。後由李水井領導。張國雄說僅吸收了張冬芳一人參加黨的外圍組織「民主革命聯盟」，其餘黨員皆由上級交其領導，人數達十餘名。剛開始是楊松齡，楊松齡再發展蔡意誠、林思儀、鄭添壽，蔡意誠又發展林丕候、林迺智、林義旭、林金木、吳慧昌、吳佳為。
第六條軸線是雙園支部。朱耀𡶐與張德和、洪某組織支部，充任書記，並領導雙園支部。涉入的被告有楊成吳。楊成吳再吸收了呂聰明。
第七條軸線是李蒼降支線。像是陳宇經由李蒼降介紹，加入共產黨。加入之後，李蒼降叫陳宇和、陳新得、蔡世揚合組支部，由陳宇負責。另外，傅賴會與李蒼降接觸，加入共產黨。1949年7月，傅賴會介紹張雲霖參加共產黨。除此之外，沈招梹和吳振壽也是屬於這一條支線。此外尚有黃銚銘。
第八條軸線是王耀勳支線。這個部分有邵水木。
第九條軸線是王忠賢支線。王忠賢先行吸收高添丁，其後吸收林麗南、吳定國。
第十條軸線是曾清根由陳水木介紹參加共產黨。曾清根介紹同鄉曾文樟參加共產黨組織。
第十一條軸線是劉英昌的網絡。介紹謝新傑入黨。
第十二條軸線是張明顯。李德輝即是因此參加共產黨。
第十三條軸線是王清泉。張秀伯即是由此加入共產黨。
第十四條軸線是黃雨生。臺灣銀行內林從周經黃雨生的介紹而加入共產黨。黃雨生指派鄭文鋒和其聯絡高懷國來領導，並且成立支部。
第十五條軸線是陳大川。主要是謝桂林由陳大川介紹加入共產黨。後由陳大川領導。
本案被告所涉及到的行為主要有：
建立武裝力量。
吸收黨員、參加與建立組織。
調查草山、烏來山等地形。
蒐購武器。
調查華南銀行與中國茶葉聯營公司之狀況。
偽造國民身份與戶口謄本。
煽惑囤積糧食、保護工廠。
最終判決中，郭琇琮、吳思漢、謝湧鏡、鄧火生、王耀勳、朱耀𡶐、許強、高添丁、盧志彬、張國雄被認為是違反《懲治叛亂條例》第二條第一項判處死刑。至於謝桂林則最後以《懲治叛亂條例》第四條第一項第六款「連續為叛徒供給金錢」判處死刑。另外，劉永福、蘇炳、李東益三人則是違反《懲治叛亂條例》第四條第一項第四款、第四條第二項，判處死刑。其中謝桂林、劉永福、蘇炳、李東益在原初軍法官鄭有齡所擬的判決中，是處以無期徒刑。不過在總統府時，透過核定程序，將這四人由無期徒刑改為死刑。
除上述之外的受難者，不少都有到綠島新生訓導處服刑的經驗。像是楊松齡、鄭溪北、林從周、蘇芳宗等人。從受難者留下的口述歷史以及官方檔案來看，在綠島新生訓導處服刑所受到的醫療照護可以說是不甚充足，固然有受難者具備醫療技術，而協助新生訓導處的醫療工作，但像是邵水木的案例即可以看到新生訓導處的醫療照護有所侷限。
另外一些受難者也在延伸出相關的案件。像是鄭溪北被懷疑涉入與戰俘梁耀光密謀劫船逃返大陸，有參加預備暴動之嫌，後來承審軍法官判處無罪；又，楊松齡則是因為林茂雄的關係，發現其有指揮其刺探軍情，吸收黨員，經覆審改判死刑。